Sztuczna inteligencja może już nie tylko pomagać naukowcom, ale także wskazywać rzeczy, których wcześniej nie zauważyli. Anthropic poinformowało, że jego model Claude, przeszukując gigantyczne bazy DNA, natrafił na nieopisany wcześniej system biologiczny. Jego budowa pod pewnymi względami przypomina CRISPR – przełomową technologię edycji genów.
- Claude, analizując gigantyczne bazy danych genetycznych, pomógł znaleźć nieopisany wcześniej system ART zbudowany wokół odwrotnej transkryptazy.
- Jego układ pod pewnymi względami przypomina CRISPR, jednak naukowcy nie wiedzą jeszcze, jaką pełni funkcję i czy znajdzie praktyczne zastosowanie.
- Anthropic traktuje odkrycie jako pierwszy przykład wykorzystania swoich modeli do autonomicznego wyszukiwania nowych zjawisk biologicznych.
Anthropic poinformowało o pierwszym odkryciu dokonanym w ramach rozwijanych przez firmę badań biologicznych. Claude miał samodzielnie przeanalizować ogromną liczbę danych genetycznych i wskazać nietypowy układ związany z enzymami zwanymi odwrotnymi transkryptazami. Enzymy te, mówiąc najprościej, potrafią przepisywać informację z RNA na DNA.
Sam enzym nie był wcześniej nieznany. Nowością jest to, że Claude zwrócił uwagę na cały system znajdujący się wokół niego: dodatkowe białko oraz długi ciąg regularnie powtarzających się fragmentów DNA.
Badacze nazwali odkryty system ART – array-associated reverse transcriptases.
950 agentów AI i 21 godzin poszukiwań
Skala eksperymentu była ogromna. Anthropic podało, że około 950 agentów Claude'a przez 21 godzin przeszukiwało wielkie bazy danych. Łącznie wykorzystały około 210 mln tokenów. Techniczny raport opisuje analizę obejmującą aż 1,9 mld klastrów białkowych.
Naukowcy określili ogólny cel poszukiwań, ale później to agenci AI analizowali poszczególne przypadki i wybierali te, które uznawali za interesujące.
Jeden z nich dostrzegł nietypowe, regularnie powtarzające się fragmenty DNA znajdujące się obok genu odpowiedzialnego za odwrotną transkryptazę. Claude przeanalizował układ tych powtórzeń i sprawdził, czy coś podobnego zostało wcześniej opisane w literaturze naukowej.
Tak wytypowany system trafił następnie do ludzi i został poddany badaniom laboratoryjnym.
Przypomina CRISPR, ale naukowcy studzą emocje
Najbardziej interesujące jest podobieństwo ART do CRISPR (CRISPR to technologia pozwalająca bardzo precyzyjnie zmieniać DNA. Działa trochę jak „molekularne nożyczki” – potrafi znaleźć konkretny fragment materiału genetycznego, przeciąć go i umożliwić jego usunięcie, zmianę albo zastąpienie). W obu przypadkach występują charakterystyczne układy powtarzających się fragmentów materiału genetycznego.
Pierwsze eksperymenty wykazały też, że fragmenty ART są przepisywane na krótkie cząsteczki RNA. Według Anthropic może to sugerować działanie podobne do innych programowalnych systemów biologicznych.
Na tym etapie nie oznacza to jednak odkrycia „nowego CRISPR”. Naukowcy nie wiedzą jeszcze, do czego ART służy ani czy system będzie można wykorzystać do edycji genów. Potrzebne są dalsze eksperymenty.
Feng Zhang z MIT i Broad Institute, jeden z pionierów technologii CRISPR, po zapoznaniu się z preprintem określił odkrycie jako interesujący przykład wykorzystania agentów AI w biologii i ocenił, że związek powtarzających się fragmentów RNA z odwrotnymi transkryptazami wymaga dalszych badań.
Anthropic wchodzi do laboratoriów
Odkrycie pojawia się w momencie, gdy Anthropic coraz mocniej angażuje się w badania biologiczne. Reuters informował wcześniej, że firma uruchomiła własne laboratorium w rejonie San Francisco, chcąc rozszerzyć działalność poza samą analizę komputerową.
Anthropic podkreśla, że to dopiero wczesny rezultat. Funkcja ART nadal pozostaje zagadką. Sam fakt, że model AI potrafił jednak przekopać ogromne ilości danych i wskazać biologiczny wzór wart późniejszego sprawdzenia przez naukowców, pokazuje potencjalnie nowy sposób prowadzenia badań.